Performances
Amadea BioPack permet de gagner énormément de temps dans la phase de développement d’une analyse. On observe typiquement des réductions importantes (facteur 5 à 30) du temps de réalisation d’une transformation par rapport à des langages de programmation classiques (SQL, PERL ou autres).
Reposant sur le Data Morphing, une technologie développée par ISoft, Amadea BioPack a été conçu pour traiter de très gros volumes de données (centaines de millions de lignes) très rapidement. Il intègre un mécanisme propre d'optimisation de la mémoire de la machine en fonction des ressources disponibles. S'adaptant facilement aux ressources disponibles, if offre ainsi une solution évolutive et simple.
Par exemple, retrouver toutes les ESTs dont les extrémités 3’ et 5’ sont présentes ensemble dans les banques de données disponibles pour obtenir les 500 000 séquences d’intérêt à-partir des 5 000 000 d’entrées de l’EMBL s’exprime en 5 opérateurs, ne requiert que quelques minutes de développement et ne nécessite que 5 minutes de traitement sur un PC.
